На зону арктических пустынь плохо воздействуют деятельность человека и природные факторы, вследствие чего возникают проблемы экологии:
потепление климата, приводящее к таянию льдов;
чрезмерный улов рыбы и браконьерство;
сокращение численности животных и птиц;
загрязнение воздуха и воды нефтепродуктами,токсическими веществами;
изменение среды обитания различных организмов в Арктике.